遥远星际的一角，一颗蓝色美丽的星球今日也是一片和平景象，人类这种生物在此繁衍生息，只可惜这份安宁在某天被所谓的怪人打破了，在世界各地出现的传送门将一个个怪人传送到了大大小小的城市地区，肆意破坏入侵着。尽管人类试图反抗击退，可是来自于更加强大的外星文明根本不是自己所能应对的。万幸的是人类经由研究怪人成功培养训练出了所谓魔法少女的存在，将怪人的因子和人类少女们协调融合，尽管受到了少数人类的反对，可这是能让她们有着和怪人一战之力的唯一手段，同时再加上怪人们的入侵每次只是少数的侵扰，并没有对整个世界产生致命的威胁，人类终于可以抵挡一部分来自怪人的入侵了。